吞噬细胞与化脓性球菌等接触后，细胞膜内陷，伸出伪足将细菌包裹形成吞噬体。吞噬体与胞内的溶酶体结合成吞噬溶酶体，溶酶体中的溶菌酶等能杀死并消化病原菌，不能消化的菌体残渣被排到吞噬细胞外，这是完全吞噬。而结核分枝杆菌、布鲁氏菌、伤寒沙门菌、军团菌等胞内寄生菌，虽然也可以被吞噬细胞吞入，但不被杀死，这是不完全吞噬。不完全吞噬可使病原菌在吞噬细胞内得到保护，有的病原菌还能在吞噬细胞内生长繁殖使细胞死亡，或者可随游走的吞噬细胞经淋巴液或血流扩散到人体其它部位，造成广泛病变。